由于三类医疗器械的使用涉及人体的生命健康，风险较高，其生产和使用需要经过政府监管部门的严格审批。在申请三类医疗器械的生产或经营许可证时，需要提供一系列的材料，包括营业执照、组织机构代码证、法定代表人身份证明、生产或质量技术负责人的身份和学历证明、生产场地的证明文件、主要生产设备和检验设备的目录、质量手册和程序文件、工艺流程图等。
对于已经生产的第三类医疗器械，如果没有唯一的标识，监管部门会要求企业进行召回，并可能处以罚款。对于未按规定实施医疗器械唯一标识的单位，药品监督管理部门会责令其限期改正，如果拒不改正或情节严重，会处以一定数额的罚款。
申请三类医疗器械的经营许可证需要按照以下步骤进行：
了解相关法律法规：仔细研读国家有关医疗器械经营管理的法律法规，了解办理许可证所需的条件、程序和要求。
准备申请材料：根据法律法规的要求，准备好申请材料。一般来说，申请材料包括企业基本信息、法人营业执照、医疗器械生产、销售或者代理经营资质证明、产品质量管理体系文件、经营场所租赁合同等。
填写申请表格：根据相关指南，填写申请表格，并且确保填写的信息准确无误。
提交申请材料：将准备好的申请材料递交给当地省级食品药品监管部门，提交方式可以是邮寄或者是亲自递交。
资质审查和现场检查：审核部门将对提交的申请材料进行资质审查，并且可能会进行现场检查，以确保申请企业具备必要的生产、销售或者代理经营条件。
审核结果通知：审核部门会根据审查和检查结果，给予办理许可证的决定，并将结果通知申请企业。如果审核通过，将会颁发医疗器械三类经营许可证。
领取许可证：根据审核结果通知，申请企业可以前往指定的地点领取医疗器械三类经营许可证。