冷链物流的有效运行，依赖的实时数据传递和与高质量信息共享。新版GSP将全面推进计算机管理信息系统的应用，并将此作为日常管理的重要手段，重点强化药品购销渠道管理和仓储温度控制环节，重点完善票据管理、冷链管理、药品运输管理这三大要求。
为了确保冷链上各企业、各物流作业环节点能够迅速准确地传递数据和共享信息资源，必需建立先进高效的现代化信息系统。各个企业应该根据自身的需求，采用WMS(仓储管理系统)、FMS(车队管理系统)、MMS(物流管理系统)和PPS(药品拣选系统)系统，实现整个冷链物流作业无纸化、信息交换实时化和网络化。
在信息系统的建设中，也要注重硬件设备与软件的有效结合，提升整体管理水平和供应链各方的协作性。在温控技术方面通过全自动远程监控系统，保证温度的有效控制。该远程监控系统可以实现远距离监视系统的运行情况，并支持参数调节、远程报警、远程故障诊断等功能;在信息设备的选用上，通过技术和功能的分析，在控制设备方面，选择电子标签、RFID(无线射频识别技术)等，配合先进管理方法使作业效率提高。追求技术的创新，设计电子标签的功能，以作为冷链物流作业中“拆零拣货”的标准化设备和功能。冷链物流管理体系应该与物流技术和设备结合，实现药品订单处理、药品出入库和药品拣选、批号跟踪、冷链管理以及车辆跟踪等自动化、信息化操作。