全所设有10余个研究部、1个装备制造部，并设有博士后工作站和信息系统工程重点实验室，投资控股南京莱斯信息技术股份有限公司、溧阳二十八所系统装备有限公司，在职职工2400余人，科技人员1600余人，研究员级高工和工程师共300余人，国家、省部级有突出贡献中青年专家、享受政府特殊津贴专家70余人。全所占地面积48万M2。建所四十多年来，已先后成功研制、生产、装备了一大批具有先进水平的军用指挥自动化系统和航管系统。与此同时，民品产业快速发展，基本形成以空中交通管制系统、城市交通控制系统、人（民）防应急通信系统、城市应急系统、劳动与社会保障信息系统、行业软件研制与开发、方舱等七大行业为主的多元化发展战略格局，并且拓展到地震、气象应急信息系统，社会征信系统，数字城市等新兴的信息化建设领域。
建所以来，二十八所已先后取得各类科技成果1000余项，获得和省部级科技进步奖200余项，其中国家科技进步特等奖2项、一等奖3项、二等奖6项，部、省科技进步特等奖9项。为我国现代化建设和国民经济信息化发展做出了重要贡献，曾荣获中共中央、国务院、中央军委颁发的某装备发展建设工程重大贡献奖。
二十八所长期坚持“两手抓、两手都要硬”的方针，紧紧围绕科研生产中心，在实现科学发展的同时，党的建设、精神文明建设和企业文化建设得到同步发展，自1988年以来连续23年保持江苏省级文明单位称号，荣获“2005～2006年度江苏省文明单位标兵”称号，2011年被中央文明委授予“全国文明单位”称号。此外，还先后荣获“全国五一劳动奖状”、“全国模范职工之家”、“全国绿色社区创建活动先进社区”、“中央企业先进集体”、“中央企业先进基层党组织”、“中央企业思想政治工作先进单位”、“中央企业五四红旗团委”等一系列荣誉称号。