一、在定义上的区别
查账征收的定义：查账征收也称"查账计征"或"自报查账"，是指纳税人在规定的纳税期限内根据自己的财务报表或经营情况，向税务机关申请其营业额和所得额，经税务机关审核后，先开缴款书，由纳税人限期向当地代理金库的银行缴纳税款。
核定征收的定义：核定征收税款是指由于纳税人的会计账簿不健全，资料残缺难以查账，或者其他原因难以准确确定纳税人应纳税额时，由税务机关采用合理的方法依法核定纳税人应纳税款的一种征收方式，简称核定征收。
第二、适用对象不同
查账征收：适用于账簿、凭证、财务核算制度比较健全，能够据以如实核算，反映生产经营成果，正确计算应纳税款的纳税人。
核定征收：主要是用在有账簿，但只能清楚核算收入或只能清楚核算成本的纳税人，不管是个体工商户还是企业，只要有账簿、但税务机关认为其核算成本不准确或核算收入不准确，都采取这种方法。
查账征收与核定征收的区别在哪里
第三、征收办法不同
查账征收：对那些税务机关认为账簿上的收入是真实的纳税人，用“收入×所得率×适用税率”的公式或“收入×负担率(核定率)”的公式计算纳税人要缴纳的税款，其中的所得率是用在企业所得税方面，是根据国家税务总局的文件在规定的范围内确定，一般是7%～30%，各个行业都不一样。
核定征收：包括定额征收和核定应税所得率征收两种办法，以及其他合理的办法。
1、定额征收，是指税务机关按照一定的标准、程序和办法，直接核定纳税人年度应纳企业所得税额，由纳税人按规定进行申报缴纳的办法。
2、核定应税所得率征收，是指税务机关按照一定的标准、程序和方法，预先核定纳税人的应税所得率，由纳税人根据纳税年度内的收入总额或成本费用等项目的实际发生额，按预先核定的应税所得率计算缴纳企业所得税的办法。
第四、两者的优缺点
查账征收：赢利才纳税，但对财务的要求较高，要规范，帐务上要能正确核算收入、成本、费用等，一般的企业都是采用这种方式。
核定征收：不管帐面怎么回事，税务机关始终按一个标准征税，计算税金简单，对财务要求较低，公司亏损也要纳税。