一、两者成立的法律依据不同
有限公司是依据《公司法》成立并规范运行的。而个体工商户是以《城乡个体工商管理条例》为依据成立、规范其运行的。
二、两者成立条件不同
1、名称不同有限公司名称有严格的规范，与公司责任形式及经营范围有关。而个体工商户字号名称法律、法规没有规范，个体工商户名称只能是贸易商行、经营部等。
2、经营场所不同有限公司必须有自己固定的经营场所及从业人员，而个体工商户没有限制，从事客货运输、贩运以及摆摊设点、流动服务的个体工商户无须固定的经营场所。
3、投资主体不同有限公司投资主体是法人，个体工商户投资主体只能是自然人。
4、财务核算要求不同有限公司必须有健全的财务管理制度，而个体工商户没有财务制度要求。
三、个体工商户与有限公司的权利、责任不同
1、有限公司的法律主体是公司，而个体工商户的法律主体是个人。
2、有限公司债务承担是有限责任，超过注册资金的债务可以申请破产。个体工商户债务承担的是无限责任，债务必须清还。
3、有限公司可以设立分支机构，个体工商户则不能设立分支机构。
4、有限公司的企业名称可以转让，而个体工商户字号名称不能转让。
5、有限公司营业执照经营期限比较长，经营范围也可以变更;个体工商户经营期限比较短，经营范围是不可以变更的。
6、两者缴纳的税费不同。个人独资企业依照国家对企业征税的有关规定执行，不需交纳管理费。而个体工商户除依法纳税外，还必须向工商行政管理机关缴纳一定比例的管理费。
7、两者的清算程序不同。个人独资企业解散，由投资人自行清算或者由债权人申请人民法院指定清算人进行清算。而个体工商户歇业时无清算程序，只需向原登记机关办理歇业手续，缴销营业执照。
8、两者承担民事责任的时效期间不同。个人独资企业解散后，原投资人对企业存续期间的债务仍应承担偿还责任，但债权人在五年内未向债务人提出偿债请求的，该责任消灭。个人独资企业应当承担民事赔偿责任和缴纳罚款、罚金，其财产不足以支付的，应当先承担民事赔偿责任。
