1.税收政策不稳定导致的风险
我国税收政策经常有新的补充和调整，这一方面为公司开展税收筹划提供了空间，另一方面又给公司税收筹划带来风险。
也就是说，在筹划期间，如果税收政策发生变化，就有可能使得依据原有税收政策设计的筹划方案，由合法变成不合法，由合理变成不合理，从而产生筹划风险。
2.对税收政策不了解导致的风险
由于我国的税收优惠政策具有很强的时效性，而且每一项优惠政策一般都有明确的条件上、地域上的限定。
而科技公司采用此种方式进行税收筹划，如若对税收优惠政策了解不及时、或者理解不透彻，又或是操作程序上的失误，丧失了享受税收优惠的机会，都会为税收筹划埋下安全隐患。
3.项目选择不当导致的风险
税收筹划涉及科技公司筹资、投资、生产、经营、分配等各个领域，涉及增值税、所得税等几乎所有的税种。
但由于每个科技公司的具体情况千差万别，有的税收筹划可能涉及一个项目、一个税种，有的可能涉及多个项目、多个税种。所以，如果科技公司未加合理选择开展筹划活动，或对项目选择不当，其筹划成功的概率必然也会较低。
