当货物经拖车运到指定出口口岸（根据订舱时的船公司及船名决定了出口口岸），货柜进入码头堆场闸口时，开始受到口岸海关的正式监管，此时货柜无论出入码头堆场都必须经过海关同意才能继续运作。（有时货柜回堆场后发现货物短装、质量有问题等，需要重新将货柜提出码头，就必须向海关申请“监管出闸”手续，在海关查核实际情况与汇报相符的情况下监管货柜离开码头堆场。）
当货柜进入码头堆场后，码头电脑会纪录此货柜的进场时间、柜号、封条号、堆场位置等信息，并通过与海关电脑联网受到海关电脑的监控。此时才可以正式向海关申报出口。首先由报关公司通过联网电脑向船代根据客户提供资料输入要报关的船名、航次、柜号、订舱号、出口单位名称、收货人名称、货物名称、件数、毛重等资料。船代收到资料并审核通过后会自动向海关电脑传输资料。（只有个别驳船公司需要船代公司负责审核上述内容，防止爆舱情况，一般船代在这里是不会每份具体审核的）。海关电脑收到资料后也会自动通过，因此所有上述资料是由报关公司根据客户提供的内容并且负责审核的。当海关电脑通过后，打印在空白装船单上，（此时叫做装船单（D/O），当海关电脑予以放行并且加盖海关印章后，就叫做“放行条”。）报关公司将装船单上的内容（主要是16位数的运输工具号码及10位数的提运单号码），通过海关允许的录入公司，正式向海关的报关电脑系统申报出口（请注意，海关只承认当海关的电脑报关系统接收到申报时的时间为报关时间，之前这么多环节只算是准备环节，因此海关要求的“提前24小时申报”指的是在某条船截关前的24小时要向海关报关电脑系统申报，当然这个要求不太实际，因为有时路途运输问题、货物生产时间问题、报关资料交接问题等都有可能导致赶船的情况出现，常见的信用证马上到期，货物刚刚好才生产出来，运到码头时当天就要截关。可是海关只有这样才会立于不败之地，因为赶不上船是我们没有按海关要求办事，不是海关做事慢而耽误。（个人意见，请勿传播，谢谢），当海关报关系统接收到后会交由审单中心负责处理深圳各个口岸传输的报关数据，目前出口商品绝大多数是由电脑自动审单，只要发送到审单中心，就会自动通过，报关公司在发送前必须严格审核所申报的资料与客户提供的内容完全一致。审核通过后，打印出口报关单后，连同报关资料（核销单、合同、发票等），报关员签字、报关公司盖章，向现场海关递单。首先递单给综合科，综合科在电脑里确认接单，需要征税的货物转给税费组，一般货物转交给风险管理科，风险管理科认为需要查验的货物进行电脑布控，不要查验的货物直接放行，转交给放行组加盖海关印章后出单给报关行。报关行将放行条交给码头进行电脑确认海关是否放行，确认后加盖码头确认章，再由报关行将放行条交给船代公司，船代公司根据放行条装船出口。当船离开港口后，船代公司会在电脑发送一份此船实际装船的舱单资料给海关的报关电脑系统，报关电脑系统与舱单资料对碰一致后才可以向海关申请打印出口外汇核销联及退税联。至此，全部报关环节完毕。
