如果公司是一般纳税人企业，部分普通发票是可以抵扣的，例如：农产品收购发票，通行费电子发票、火车票机票，机动车销售统一发票等。下面分情况进行介绍：
1、农产品收购发票
一般是指农产品加工企业向农户收购农产品，由企业自行具实开具给农户，企业以开票金额自行计提进项进行抵扣的情况。
政策支持：《财税[2017]37号 财政部国家税务总局关于简并增值税税率有关政策的通知》
取得（开具）农产品销售发票或收购发票的，以农产品销售发票或收购发票上注明的农产品买价和11%的扣除率计算进项税额。
《财政部 税务总局海关总署公告2019年第39号 财政部 税务总局 海关总署关于深化增值税改革有关政策的公告》
二、纳税人购进农产品，原适用10%扣除率的，扣除率调整为9%。纳税人购进用于生产或者委托加工13%税率货物的农产品，按照10%的扣除率计算进项税额。
2、通行费电子发票、火车票机票
公司车辆发生的过路过桥费汇总开具的电子普通发票，员工打网约车报销电子普通发票以及员工出差的火车票机票等可以抵扣，按票面含税9%计算抵扣。
政策支持：《财政部税务总局 海关总署公告2019年第39号 财政部 税务总局 海关总署关于深化增值税改革有关政策的公告》
六、纳税人购进国内旅客运输服务，其进项税额允许从销项税额中抵扣。
（一）纳税人未取得增值税专用发票的，暂按照以下规定确定进项税额：
1.取得增值税电子普通发票的，为发票上注明的税额；
2.取得注明旅客身份信息的航空运输电子客票行程单的，为按照下列公式计算进项税额：
航空旅客运输进项税额=（票价+燃油附加费）÷（1+9%）×9%
3.取得注明旅客身份信息的铁路车票的，为按照下列公式计算的进项税额：
铁路旅客运输进项税额=票面金额÷（1+9%）×9%
4.取得注明旅客身份信息的公路、水路等其他客票的，按照下列公式计算进项税额：
公路、水路等其他旅客运输进项税额=票面金额÷（1+3%）×3%
3、机动车销售统一发票
企业采购的固定资产车辆类，可机动车销售统一发票内容齐全的情况下，可以进行抵扣。
政策支持：《国家税务总局公告2020年第1号国家税务总局关于增值税发票综合服务平台等事项的公告》
四、纳税人同时丢失已开具增值税专用发票或机动车销售统一发票的发票联和抵扣联，可凭加盖销售方发票专用章的相应发票记账联复印件，作为增值税进项税额的抵扣凭证、退税凭证或记账凭证。
纳税人丢失已开具增值税专用发票或机动车销售统一发票的抵扣联，可凭相应发票的发票联复印件，作为增值税进项税额的抵扣凭证或退税凭证；纳税人丢失已开具增值税专用发票或机动车销售统一发票的发票联，可凭相应发票的抵扣联复印件，作为记账凭证。
