公司注销时账面上有未分配利润存在是，需要先确定下是否属于清算后所得，如果是清算后的结余需要缴纳个人所得税。这种情况，一般是按照实收资本中自然人股东占比来计算分红的个税。政策依据是财税2009第60号文“关于企业清算业务企业所得税处理若干问题的通知”。
（2）账面上有存货没有实物如果存货已经销售，却没有做账，没开发票，销售成本不结转，会导致存货数大于实际库存。发生这种情况会被认定为涉嫌偷税漏税，企业需要马上自查并且补缴相关税款，不然被税务稽查到就麻烦了。因此税务注销前，一定要专业的财务人员进行税务自查。
如果存货是已经被损毁了，需要查名原因，如果是真实合理损耗，那么增值税无需处理，如果非正常损失的话，增值税进项就不能抵扣了。政策依据是财税2009号第57号文第十条的规定“企业因存货盘亏、毁损、报废、被盗等原因不得从增值税销项税额中抵扣的进项税额，可以与存货损失一起在计算应纳税所得额时扣除”
3.公司注销常见问题答疑
A:这种情况下可能会涉及到缴纳个人所得税哦。
借给个人股东，注销的时候还未偿还，依照“利息、股息、红利所得”项目计征个人所得税。
借给企业员工，注销的时候还未偿还，依照“工资薪金所得"项目计征个人所得税
因此，企业注销前一定要好好自查一下“其他应收款”等往来科目
Q：公司注销，如果已经是非正常户了，税务已经非正常了，如何处理A：税务已经非正常，被纳入了非正常户的话，需要**行补税申报，去税务局解除异常，缴纳对应的罚款和滞纳金。只有解除非正常状态后，才能按照正常的注销程序进行注销办理。
Q:注销一定会查三年账吗？
A：首先给出答复：不一定，一般情况下不会。没有税法规定明确说企业注销要查账，而且必须查三年账，这个要根据企业实际情况来。你的企业正常经营申报，然后确实有原因需要注销办理，这种情况下税务局只会配合纳税人，做好税务清算注销流程，不会有查账一说。之所以大家会有这个说法，是因为根据《税收征管法》中规定说“因税务机关的责任，致使纳税人、扣缴义务人未缴或者少缴税款的，税务机关在三年内可以要求纳税人、扣缴义务人补缴税款，但是不得加收滞纳金”。因此大家会有这个误判。
有关公司注销相关事项您已经清楚了！所以不用担心企业注销问题。创业你做主，财税我来帮。上海企帮帮，提供一体化财税解决方案，有任何疑问，欢迎咨询，第一时间为您解答！