1. 公司被认定为风险纳税人
很多企业在开始经营后，对于税务问题不够重视，没有及时做记账报税，申报出现错误，或者是持续做零申报等等原因，都会导致公司被税务机关列入风险纳税人。与被列入经营异常名录一样，如
果不及时整改，根据要求补缴税款和罚款，公司也是没有办法顺利注销的。
2. 公司设有分支机构
一些企业在发展步入正轨后，为了扩大公司的经营范围，会设立分支机构以谋求在新行业中的发展，这类企业需要注意的是办理注销的顺序：先注销分支机构，再办理母公司的注销手续。
3. 注销流程错误
*后一类就是*常见的，有些企业在办理注销之前过于想当然，认为注销手续和申领执照时相似，都是先去工商局再去税务局。实际上，经历了实际经营的公司，需要先做资产清算，办理税务注销，再办理工商注销等等手续，才能真正完成注销。
4. 公司被列入经营异常名录
在之前的运营过程中，如果公司出现一些违规行为，就有可能被登记机关列入经营异常名录。很多企业对此不在意，觉得反正公司要注销了，办完手续就可以一笔勾销。实际上，根据规定，经营情况出现异常的企业要视异常情况，有的无法直接办理公司注销，需要按照要求先行整改，待机关核查后将公司移除异常名录，才可以继续办理注销。