税务人申请代开增值税发票办理流程：
1、提交《代开增值税发票缴纳税款申报单》;
2、自然人申请发票，提交身份证以及复印件;
3、相关合同或者协议。
个人未办理税务登记，个人提供增值税的应税服务以应税劳务需要按次确定增值税的起征点;需要缴费增值税以及附加、个人所得税，增值税征收率3%。提供劳务报酬所得的个人所得税税率是20%，劳务报酬所得以收入减除百分之二十费用后的余额为收入。
自然人代开的优势在哪里?
因为就是自然人做的业务，向自然人支付服务款，符合商业实质，不存在虚开风险。另一方面个人按照生产经营所得缴税，开出的发票都是服务费而不是劳务费发票，个税完税证明也明确是生产经营所得。按照税法，生产经营所得是不可代扣代缴的，也不存在代扣代缴风险。
是自然人代开，发票不进入金税三期风控系统，大额开票稽查风险小，并且自然人代开不存在强制升级为一般纳税人的情况，增值税为小规模的1% ，成本也极低。
自然人开票还不需要注册公司、日常维护和注销清算，周期和流程都很简单。
当然，自然人代开也有需要注意的地方，需要注意6大事项：
(一)自然人代开基本都是普票，且是个人性质的发票;
(二)代开时需要问清楚受票方是否能够接受异地发票;
(三)根据实际业务代开品目，以防存在虚开嫌疑;
(四)选择的自然人，名下不能有个独、个体工商户、甚至有限公司;
(五)自然人不能是受票方公司拿工资缴纳社保的人;
(六)保证业务真实，注意三流一致。