上海市高新技术成果转化认定流程如下：自我评价。企业根据《上海市高新技术成果转化项目认定办法》的认定条件进行自我评价，符合条件的可申报认定。
网上申报。企业通过“上海市科技创新云服务平台”进行申报，在线填写《上海市高新技术成果转化项目认定申请书》。
在线提交以下主要材料：
（1）认定申请书。
（2）知识产权证明（发明专利申请公开、发明专利授权、实用新型专利授权、软件著作权登记、植物新品种登记等）。
（3）申报日之前三年内转让或许可他人使用的证明（技术转让合同、专利实施许可合同等）。
（4）产品检测报告、安全检测报告、产品验收报告等相关证明材料。
（5）其他相关证明材料。
电子材料确认。上海市科技创业中心在线确认提交的电子材料，符合要求的，进入受理程序；不符合要求的，退回并说明理由。
提交纸质材料。通过认定评估的，在线打印《上海市高新技术成果转化项目认定申请书》并签字、盖章后，连同其他纸质材料送至注册所在地的区科技行政管理部门。
纸质材料受理和初审。各区科技行政管理部门受理企业在“上海市科技创新云服务平台”上提交的纸质材料，对电子件与纸质件的一致性进行核查，并出具受理回执。
专家评审。市科委根据申报情况，组织专家对申请项目进行评审。
综合评审。市科委根据专家评审意见，对项目进行综合评审，并按照择优支持的原则确定拟认定项目。
公示与公告。市科委将拟认定项目在网上公示7日，对公示无异议的项目，正式发文公告并颁发《上海市高新技术成果转化证书》。高新技术企业认定https://www.91kaiye.cn/gxrz/
以上就是上海市高新技术成果转化认定的全部流程，完成认定后，企业可以享受相关政策扶持。