企业注销要比注册更加复杂，毕竟企业经营了很久了，会有很多经济上的往来，当然这些经济往来也会隐藏一些税务风险，这些风险可能经营过程中不会显现，而一旦注销公司就会“爆雷”。这些容易“爆雷”的坑一定要妥善处理：
一、账面有存货无实物
这是一个大坑，如果账面上有存货，注销时这些存货视作已经销售，需要补增值税与企业所得税。
如果被认定已经销售出去：已经销售的货物不做账、不开发票，隐瞒销售收入，销售成本不结转。不但要补税，还要承担滞纳金及相应的罚款。
如果是货物已经损失，需要做损失处理。当然需要做损失处理，不仅仅只是在账务上做分录，还要有明确的证据。需要有企业内部的报损申报单，有内部领导签字，如果数额大，还需要有损失的照片。
如果存货已经过期。有保质期的的产品，过期后需要计提资产减值损失。（小企业准则计入营业外支出）
如果存货在注销前进行了低价出售。注销前的低价出售行为是被允许的，但一些市面上流通性很强的商品，如大宗商品、黄金这些流动性很强的市场价格不能过于低。
二、往来账款要清理
1、未满三年的应收账款。
企业注销后，应收账款大概率是无法收回的。但在税务上，并不会因为你注销公司，而允许你税前扣除，未满足条件的坏账。对于一般企业来说，满三年应收计入坏账税前扣除是Zui常见的。而通过司法程序，或对方破产而确认坏账的情况比较少，且获得允许扣除凭证也麻烦。
会计应对：如果该坏账不影响税，直接不予考虑即可。如果影响到了纳税，不妨企业晚注销3年，也让这三年税务上干净一些。
2、员工及股东对企业的欠款。
员工及股东的欠款，是一定要追回的。如果实在无法追回，企业应将此笔欠款视作员工工资或股东分红，负担代扣代缴义务。
三、增值税留抵退税
如果企业还有未退增值税留抵退税额，这时会计就要多一个心眼，因为一但注销，该笔留抵退税额就作废了，企业白白损失这么多税款。
政策依据：财税〔2005〕165号的规定，企业注销后，存货中尚未抵扣的已征税款以及留抵税额，税务机关都是不予退还的。
会计应对：一般会计会向其他企业开票，将未抵扣尽的进项税全部用完。但要注意，不要虚开增值税发票。需要在真实交易下，将增值税转到下游企业。
四、印花税
存续期间的企业，印花税是Zui大的问题，有很多企业常年不缴纳印花税。而由于印花税税率低，税务部门在企业存续期间不重视，也很少有提醒你缴纳的。但注销的时候，一定要记得补足印花税。补交印花税并不会加收滞纳金，但因为印花税问题引起注销前税务清查，那就得不偿失了。
五、债权债务
有债务的情况下，是无法注销完成的。注销前要先进行债务清偿，Zui低要求也是在注销清算期，不能让债权人提出异议。（一般注销的企业规模不会太大，根本无法、也没有那么多钱走破产清算程序，只能安抚完债权人后，才能完成注销）
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