在上海长宁区办理公司股权变更，可以按照以下步骤进行：
准备相关材料：
公司营业执照正副本原件（如果未进行三证合一，还需带上组织机构代码正副本原件、税务登记证正副本原件）。
法定代表人签署的《公司变更登记申请书》（需公司加盖公章）。
指定代表或共同委托代理人的证明（公司加盖公章）以及指定代表或委托代理人的身份证复印件（本人签字）。
股权转让协议。
股权转让给公司股东以外的，应提交新股东大会（股权转让后的股东）决议（全体新股东盖章或签字，自然人股东签字，自然人以外的股东盖章）。
章程修正案或修改后的章程。
如果有涉及到组织机构变化的，还应提交相应的变化情况文件。
提交材料：将所有准备齐全的材料提交给长宁区的工商行政管理部门进行审批。在此过程中，可能需要缴纳相关费用。
审核与受理：工商行政管理部门收到材料后会进行审核，如果材料齐全并符合要求，会出具受理通知书。
领取新的营业执照：凭受理通知书，您可以在指定的工作日后前往工商窗口领取新的营业执照。这标志着股权变更的基本完成。
请注意，这只是一个基本的流程概述。实际办理时，可能还需要考虑其他因素，例如是否需要更新其他相关证照（如税务登记证、组织机构代码证等），以及是否需要通知其他相关部门或机构（如银行、合作伙伴等）。因此，建议在办理前详细咨询长宁区的工商行政管理部门或机构，以确保流程的顺利进行。同时，办理过程中应遵守相关法律法规，确保所有文件的真实性和合法性。
