第二类医疗器械注册证办理的难度相对较高，但并非不可逾越。在办理过程中，需要注意以下事项：
企业需要了解和遵守相关法规和标准。中国对医疗器械有着严格的管理制度，企业必须熟悉和遵循《医疗器械监督管理条例》等相关法规，要确保产品符合相关标准要求。
企业需要建立完善的质量管理体系。医疗器械的质量直接关系到患者的安全和健康，企业必须建立完善的质量管理体系，包括原材料控制、生产过程控制、产品检验等环节，并且要保证体系的合规性和有效性。
企业需要准备充分的申请材料。申请第二类医疗器械注册证需要提交多方面的材料，包括产品技术资料、生产工艺流程图、产品样品、标签和包装标识等，还需要按照相关法规要求提交其他必要的文件和资料。企业需要保证材料的真实性和完整性，并且要注意不同部门对材料的具体要求。
企业需要接受审核和现场检查。在提交申请后，相关部门会对企业提交的材料进行审核，并可能进行现场检查和抽样检测。企业需要配合审核和检查工作，并且要积极解决问题和改进质量。
第二类医疗器械注册证办理的难度相对较高，但只要企业了解相关法规和标准要求、建立完善的质量管理体系、准备充分的申请材料并接受审核和现场检查，就有可能成功办理第二类医疗器械注册证。