外贸企业出口退税流程第二步是企业应在货物报关出口后，及时取得出口货物报关单，并登录电子口岸，查询比对出口信息与纸质报关单是否一致。若一致，应在每个工作日的上午8：00至下午16：00向国税局提交电子信息。
三、根据主管税务机关要求，使用指定的外贸企业出口退税申报软件录入出口退税信息，生成出口退税申报数据，传递至软盘。
四、整理、装订外贸企业出口退税报表、单证成册，在规定的申报时间内办理出口退税正式申报。若申报数据准确、单证无误、报表一致，则通过审核，转入审批环节;若存在需要调整、更正的数据或单证及报表，则应按主管税务机关的要求进行处理。
五、对于已经审批完毕的出口货物，主管税务机关将按法定程序办理退库手续。外贸企业应根据银行退转的出口退税退付凭证进行账务处理，至此申报完毕。
附：外贸企业出口退税申报录入的操作流程
基本要求：
1、申报软件：外贸企业出口退税申报系统10.0版(该软件下载、安装，并进行系统维护，之后方可操作使用)
2、申报系统安装路径：c:/出口退税/出口退税申报系统10.0版
3、拷取或下载认证发票信息的保存路径：a:/出口退税/认证发票信息
4、网上下载预审反馈信息的保存路径：c:/出口退税/审核反馈信息