连锁企业商业模式组织结构是指一个组织内各构成要素以及它们之间的相互关系，主要涉及企业部门构成、基本的岗位设置、权责关系、业务流程、管理流程及企业内部协调与控制机制等。下面是深圳逸马连锁企业培训咨询精华班课程带来的连锁企业商业模式组织设计要点的简单介绍。
说起连锁企业商业模式组织设计，我们可以从以产权为中心的机制运营出发去理解，连锁企业的特点表现为：
，其组织形式的多样性与开放性，比如：分公司形式、合作公司形式、加盟商形式等等，其优势是可以充分的整合社会闲置资源，直接转化为生产力，创造巨额利润。
第二，其在终端的丰富延展性，能够像细胞一样快速繁衍、自我生长，以短的时间和小的成本迅速。
第三，连锁经营把集中决策、分散经营相结合，即能体现连锁经营作为一种治理标准的统一性，又能因时因地制宜，保持创新与个性。连锁经营显而易见的组织形式上的优势，使得其深刻影响到传统产业与传统经营方式，以至于我们看到：制造业的“商业连锁冲动”；资本市场对连锁经营的“宠爱有加”。
逸马集团在对连锁企业提供咨询服务的过程中发现，现在国内很多企业已经深刻的意识到连锁经营作为一种经营模式给传统经营模式带来的巨大冲击与影响。但连锁企业商业模式经营作为更深一层次的企业组织形式，其到底该如何设计，怎样才能设计好？是摆在中国企业界的理论困惑与实践困惑。
组织结构设计的内容主要有：
1、 按照企业战略目标要求，建立合理的组织架构，包括各个管理层次和职能部门的建立；
2、 按照业务性质进行分工，确定各个部门的职责范围；
3、 按照所承担的职责赋予各部门、各管理人员相应的权力；
4、 明确上下级之间、个人之间的领导和协作关系，建立畅通的信息沟通渠道；
5、 设计企业的业务流程、管理流程和相应的组织文化，以保证所建立的组织结构有效地运转；
影响阶层数的因素有很多，例如控制幅度、过于细分工作的差异性、工作的性质与种类、组织沿革与习惯，甚至薪资制度也有影响。