EDI许可证和ICP许可证在以下方面存在不同：
定义：
ICP许可证（Internet ContentProvider）是指通过互联网向用户提供有偿信息服务的业务所需的证书。根据《互联网管理办法规定》，经营性网站必须办理ICP证，否则就属于非法经营。它主要涉及信息发布平台、递送服务、信息搜索查询、信息社区平台、信息即时交互以及信息保护和处理等服务。
EDI许可证（Electronic DataInterchange）是指利用各种与公用通信网或互联网相连的数据与交易/事务处理应用平台，通过公用通信网或互联网为用户提供在线数据处理和交易/事务处理的业务。这包括交易处理、电子数据交换以及网络/电子设备数据处理等业务，如银行业务、股票买卖、票务买卖、拍卖商品买卖、费用支付等。
经营业务：
ICP许可主要面向的是信息服务和内容发布，如在线支付、充值平台、网上广告、代制作网页、有偿提供特定信息内容、电子商务等。
EDI许可则主要面向在线数据处理和交易/事务处理业务，例如电商平台、银行业务处理、股票交易等。
EDI经营许可证是在各省的通信管理局申请办理的。具体来说，外资办理EDI经营许可证的流程稍微有些不同，需要先向国务院申请外商投资批准证书，然后向国家工信部通信司申请办理准入证。获得批准证书之后，外资企业才可以去当地通信管理局或者工信部官网进行申办EDI经营许可证。
对于申请EDI经营许可证的具体步骤，一般包括：
申请：申办企业先登录通信管理局（工信部）官网进行网上申请EDI经营许可证，并说明类别。
提交：网上申请通过后，申办企业提交申报材料，并报送相关材料。
初审：通信管理局（工信部）对企业提交的材料进行初步审核。
受理：通信管理局（工信部）初审后向申办企业发出受理通知书，并将受理材料分送到相关部门审查并核实。
决定：通信管理局（工信部）将在规定日期内做出是否批准经营决定。如无法通过，会以书面的形式通知申办企业，并说明理由。