上海代办二类医疗器械备案网上填报流程及上传资料参考如下：
1. 登陆上海市市场监督管理局（https://shanghai.business.gov.cn/），点击“许可办”专栏。
2. 找到“医疗器械”模块下“第二类医疗器械经营备案”事项，填写办理登记表。
3. 上传“企业、法人身份证”正反面，办理人员是经办人员的，“经办人身份证”正反面也需要上传。
4. 上传公司的“营业执照、食品药品经营许可证”，可能根据Zui新要求会变化，zuihao查询官方Zui新通知。
5. 将需要办理二类备案的相关材料提交后，等待审核结果。
以上信息仅供参考，具体流程和要求可能会因地区而异，建议咨询当地市场监督管理局或政务网站平台获取详细信息。
以上流程仅供参考，建议咨询相关部门获取准确信息。
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