申请食品经营许可证需要准备以下材料：
食品经营许可申请书。
营业执照或者其他主体资格证明文件复印件。
与食品经营相适应的主要设备设施布局、操作流程等文件。
食品安全自查、从业人员健康管理、进货查验记录、食品安全事故处置等保证食品安全的规章制度。
如果利用自动售货设备从事食品销售的，申请人还应当提交自动售货设备的产品合格证明、具体放置地点，经营者名称、住所、联系方式、食品经营许可证的公示方法等材料。如果申请人委托他人办理食品经营许可申请的，代理人应当提交授权委托书以及代理人的身份证明文件。
食品经营许可证的申请流程一般包括以下步骤：
填写食品经营许可证的申请表，内容需完整、清晰，并加盖申请人公章。
准备相关的证明材料，如营业执照或其他主体资格证明文件复印件、与食品经营相适应的主要设备设施布局和操作流程文件、食品安全自查、从业人员健康管理、进货查验记录、食品安全事故处置等保证食品安全的规章制度等。
如果利用自动售货设备从事食品销售，还需要提交自动售货设备的产品合格证明、具体放置地点、经营者名称、住所、联系方式、食品经营许可证的公示方法等材料。
将申请表连同以上材料一并提交给当地食品药品监督管理部门或市场监督管理局。提交方式可以是现场提交或在线提交，具体视当地要求而定。
相关部门将对申请材料进行审核，包括材料的完整性、准确性和合规性。必要时，他们可能会进行现场核查，检查经营场所、设备设施、操作流程等是否符合要求。
如果审核通过，申请人需按要求缴纳相关费用（如有），然后领取食品经营许可证。领取方式可以是现场领取或通过邮寄等方式领取。