当公司要申请医疗器械二类备案时，应做的准备工作包括：
了解相关法规和标准：确保对医疗器械相关法规和标准有充分了解，以便产品能够符合相关要求。
产品定义和分类：根据产品特性和用途，确定其分类（如一类、二类或三类），这涉及到产品的风险级别和市场准入要求。
编制产品技术文档：准备详细的产品技术文档，包括产品说明书、使用指南、安装和维修手册等。
进行产品测试：根据相关标准和规定，进行产品测试，确保其性能和安全性符合要求。
准备生产和质量控制体系：建立生产和质量控制体系，确保产品的一致性和可靠性。
申请文件准备：根据相关法规和标准，准备申请文件，包括企业基本情况、生产条件、质量管理体系文件、符合性声明等。
选择合适的认证机构：认证机构将对您的产品和体系进行审核，确保符合相关标准和规定。选择一个有资质和经验的认证机构是关键。
与当地监管机构沟通：在提交申请前，与当地监管机构进行沟通，了解具体的申请要求和流程。
培训和人员资质：确保有足够的合格人员来生产和质量控制产品，并确保他们接受了适当的培训。
设施和设备：确保有适当的生产和质量控制设施和设备。
风险管理和应急计划：制定风险管理和应急计划，以应对可能出现的产品安全问题或其他紧急情况。
持续改进和监控：建立持续改进和监控机制，以评估产品的性能和市场反馈，并根据需要进行调整。
配合审核和监督检查：在提交申请后，配合认证机构和监管机构的审核和监督检查，确保顺利通过。
申请流程包括：
准备申请资料：根据当地监管机构的要求，准备齐备的申请资料，包括企业基本情况、生产条件、质量管理体系文件、符合性声明等。
提交申请：将申请资料提交给当地监管机构。
审核资料：当地监管机构将对申请资料进行审核，包括资料的真实性和完整性、产品符合法规和标准的情况等。
现场核查：如果需要，当地监管机构会对企业的生产和质量控制体系进行现场核查。
审核结论：当地监管机构会根据审核情况给出结论，如果申请被批准，会颁发医疗器械二类备案证明。
必要条件包括：
企业应具有与经营规模和经营范围相适应的质量管理机构或者专职质量管理人员，质量管理人员应当具有国家认可的相关专业学历或职称。
企业应具有与经营规模和经营范围相适应的相对独立的经营场所。
企业应具有与经营规模和经营范围相适应的储存条件，包括具有符合医疗器械产品特性要求的储存设施、设备。
企业应当建立健全产品质量管理制度，包括采购、进货验收、仓储保管、出库复核、质量跟踪制度和不良事件的报告制度等。
企业应当具备与其经营的医疗器械产品相适应的技术培训和售后服务的能力，或者约定由第三方提供技术支持。
对于某些特定的医疗器械产品，企业还需要满足额外的要求，例如植入类医疗器械需要配备相应的专业卫生技术人员，特殊验配要求的医疗器械需要配备相关专业人员等。
企业应按《医疗器械经营企业现场检查评分表》进行自查，每部分得分率不低于80%。