相比普通药物的物流运作，医药冷链对硬件和软件的投入要求更高，不仅需要有冷库、冷藏车、冷包、冰排、温度计等设施设备，必须配备相应的温湿度自动监测系统，还需要进行验证管理，验证这些设备和监测系统能否达到规定的设计标准和要求，各种冷链设备在不同季节的气候条件下性能是否都有保证，设备使用一定年限后是否会性能不稳定等等，这些都需要通过科学严谨的验证来确认。
从事医药冷链业务的企业，还必须制定应急预案，对存储和运输过程中可能发生的设备故障、异常天气、交通拥堵等突发事件，采取相应的应对措施，防止因异常情况造成的温度失控。一般情况下，冷藏库内要配备双套制冷机组，一用一备，交替工作，且须有双路供电系统或安装有备用发电机，以保证冷库制冷、温度监控和报警用电不间断。用于长途运输的冷藏车上的制冷设备也应是“一主一辅”，做到双保险。
正因如此，医药冷链物流对操作的标准化和严谨性要求就比较高，需要企业对员工进行技能方面的培训。