冷链体系的运营成本要比常温物流高2－3倍左右，但在零售端的价格上与普通商品类别上差距不大，只能由物流企业自行消化或无法持续投资，也挫伤了经营积极性。为了节省成本，许多企业用恒温车或保温车来代替冷藏车进行运输。有统计表明：我国80％左右的水果、蔬菜、肉类和水产用传统车厢(常温和保温车)进行运输，冷藏措施一般仅采用土法冷藏，冷藏温度无法达到要求。
原先的生产企业销售模式基本上是2B的，物流模式也非常简单。但近年来，除了2B以外还有2C。直播带货也逐渐兴起，需求更为分散、灵活，快捷，2C的冷链物流体系发展尚跟不上这种变化。
农副产品、水产品和药品是以一定温控为条件的，意味着从产地到消费者手中都必须具有一定的温控，以保证产品保鲜期、保质期的需要，这使得冷链的技术和标准十分重要和关键。
由于冷链与居民饮食卫生要求、身体健康安全息息相关，加快政府监管体系建设也是责无旁贷，应根据食品安全质量控制要求对农副产品、食品、药品的保质期、外包装、外观以及内部温度，运输过程中的温度连续性进行严格检查，加大对违规企业的处罚力度，建立行之有效的社会监管体系。
冷链物流政策热不能替代社会发展冷链物流的路径，更不能忽视冷链物流企业步履艰难的现实，多个难点的存在决定了我国冷链物流的发展必须找到政府、消费者、农业生产和物流企业等多方面参与者的利益平衡点，不一定有优方案，但存在妥协选择。